Heladia Salgado

Técnica Académica Titular C · Lic. en Informática

Centro de Ciencias Genómicas, UNAM · Cuernavaca, México · en la UNAM desde 1994

Regulación transcripcional Bioinformática Desarrollo de software científico RegulonDB IA en ciencia

👤 Sobre mí 🎓 Docencia 📄 Publicaciones 🚀 Proyectos ✉️ Contacto GitHub

Sobre mí

Soy técnica académica titular C en el Programa de Genómica Computacional del CCG-UNAM, licenciada en Informática por el Instituto Tecnológico de Zacatepec. Llevo en la universidad desde 1994 y mi trabajo gira en torno a la bioinformática, la regulación génica bacteriana y el desarrollo de software científico.

Coordino el desarrollo de software de RegulonDB y, en los últimos años, integro inteligencia artificial en infraestructura científica y formación —incluyendo el proyecto PAPIIT de repositorio de prompts en el CCG y mis cursos en la LCG.

Desde 2023 me actualizo en IA aplicada al software y la educación: cursos en el CCG y la UNAM, el máster AI4Devs de LIDR Academy y, en curso, su programa AI Engineering (LLMs, RAG, embeddings y agentes). Soy instructora certificada de The Carpentries.

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RegulonDB

Coordinación del desarrollo de software del equipo e integración entre el modelo biológico y su implementación tecnológica.

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Repositorio de recursos de IA

Desarrollo, documentación y uso responsable de prompts y herramientas con IA generativa para investigación y formación en el CCG.

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Docencia

Introducción a la Bioinformática y Desarrollo de software con Python en la LCG-UNAM.

Técnica académica titular C desde 2017; en la UNAM desde 1994
Premio Sor Juana Inés de la Cruz, UNAM (2011) · Mérito universitario 25 años UNAM (2024)
Investigadora nacional SNI Nivel 1 (2005–2023) · PRIDE Nivel D

Perfil institucional en el CCG · Google Scholar

Docencia

En la Licenciatura en Ciencias Genómicas (LCG-UNAM) imparto cursos de base computacional para la bioinformática y el desarrollo de software científico. También ofrezco materiales sobre prompting científico e IA aplicada a la investigación.

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Introducción a la Bioinformática

LCG-UNAM · Unix, fundamentos de bioinformática, documentación con Markdown y diagramas con Mermaid.

LCG

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Desarrollo de software con Python

LCG-UNAM · buenas prácticas de desarrollo de software, Git, GitHub, Python y uso de IA para desarrollo.

LCG

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Prompting Científico con IA

Curso sobre epistemología del prompting, arquitectura de LLMs y diseño de prompts para investigación científica. Incluye protocolo MalT y rúbricas de evaluación.

Sitio activo

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Desarrollo Científico Aumentado por IA

Curso de 10 sesiones sobre Context Engineering, Scientific Spec-Driven Development y pipelines computacionales reproducibles con IA.

En construcción

Publicaciones

Selección por primer autor, número de citas e impacto en revistas de alto nivel (según CV UNAM 2025).

RegulonDB v12.0: A Comprehensive Resource of Transcriptional Regulation in E. coli K-12

Salgado H., Gama-Castro S., Lara P., Mejía-Almonte C., et al.

Nucleic Acids Research, 2023 · Vol. 51 (D1): D146–D154 · primer autor

DOI PubMed

RegulonDB version 9.0: High-Level Integration of Gene Regulation, Coexpression, Motif Clustering and Beyond

Gama-Castro S., Salgado H., Santos-Zavaleta A., et al.

Nucleic Acids Research, 2016 · Vol. 44 (D1): D133–D143 · 354 citas

DOI

RegulonDB (version 6.0): Gene Regulation Model of E. coli K-12 beyond Transcription, Active Annotated Promoters and Textpresso Navigation

Gama-Castro S., Jiménez-Jacinto V., Peralta-Gil M., et al., Salgado H.

Nucleic Acids Research, 2007 · Vol. 36 (D1): D120–D124 · 384 citas

DOI

RegulonDB version 7.0: Transcriptional Regulation of E. coli K-12 Integrated within Genetic Sensory Response Units (Gensor Units)

Gama-Castro S., Salgado H., Peralta-Gil M., et al.

Nucleic Acids Research, 2011 · Vol. 39 (D1): D98–D105 · 286 citas

DOI

Operons in Escherichia coli: Genomic Analyses and Predictions

Salgado H., Moreno-Hagelsieb G., Smith T.F., Collado-Vides J.

PNAS, 2000 · Vol. 97 (12): 6652–6657 · primer autor · 270 citas

DOI

RegulonDB v8.0: Omics Data Sets, Evolutionary Conservation, Regulatory Phrases, Cross-Validated Gold Standards and More

Salgado H., Peralta-Gil M., Gama-Castro S., et al.

Nucleic Acids Research, 2013 · Vol. 41 (D1): D203–D213 · primer autor

DOI

Proyectos

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RegulonDB

Base de datos de referencia mundial para la regulación transcripcional en E. coli K-12. Coordino el desarrollo de software del equipo y la integración entre el modelo biológico y su implementación tecnológica.

Activo

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Repositorio de recursos de IA · CCG

PAPIIT IF202226 (2026–2028): plataforma institucional para desarrollar, documentar y compartir prompts, GPTs y herramientas con IA generativa; repositorio en GitHub, interfaz web de consulta y formación en ingeniería de prompting. Responsable del proyecto.

Vigente

Contacto

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